[5]此书记载丛林的一切事务，诸如：法堂、僧堂、方丈的设置，十贤众的任职。十职分为西序：首座（前堂、后堂）、书记、知藏、知客、知浴；东序：监寺、维那、副寺、典座、直岁。又设置寮元、堂主、化主、庄主、知殿等。举凡大众的朝参、夕聚、斋粥、普请等，皆有规定。学众聚居僧堂，依受戒年次安排，并设长连床，供坐禅偃息。住持必须是兼具道眼及德行者，时时上堂升座、小参垂示，以御大众。凡此种种遂成为丛林新例，而与律法不同。
[6]据《敕修百丈清规》卷上《住持章》所载，包括：（一）上堂：在法堂对大众说法；（二）晚参：晚上在法堂对大众说法垂示；（三）小参；（四）普说；（五）入室：适时应机调御禅子；（六）告香：对新挂单僧说法开示；（七）念诵；（八）巡寮；（九）肃众：即监督大众；（十）训童行：督导寺中年少未获剃度者；（十一）为行者普说；（十二）受法衣：接受承继大法的法衣信物；（十三）迎侍尊宿；（十四）施主请升座斋僧；（十五）受嗣法者之茶点接待；（十六）嗣法师遗书至。另于《禅林象器笺》卷六所载住持的职责，则概括为说法、安众、修造等三大项。
[7]系宋代禅僧长芦宗赜集，又称《崇宁清规》、《重雕补注禅苑清规》、《禅规》。有关禅院的清规，最早始于唐代百丈怀海所撰述的《百丈古清规》，至北宋时，《古清规》已散逸，禅林规则紊乱，宗赜为再兴百丈清规的精神，遂搜集残存于诸山的行法偈颂，编撰该清规。其后，中国、日本所制定的清规，皆以该清规为标准。